Un equipo internacional de científicos ha desarrollado un nuevo método computacional, AGGRESCAN3D (A3D), que permite estudiar en tres dimensiones la estructura de las proteínas globulares plegadas y mejora sustancialmente la predicción de su propensión a formar agregados proteicos tóxicos.
El A3D supera las limitaciones actuales con una aproximación basada en la estructura de las proteínas desde estados plegados. El nuevo algoritmo tiene una precisión significativamente más alta que los basados en secuencias lineales para predecir las propiedades de agregación de las proteínas globulares y aporta nuevas e importantes prestaciones, entre las que destaca la posibilidad de modelar fácilmente mutaciones patogénicas o rediseñar proteínas de interés terapéutico, como anticuerpos, con funcionalidad incrementada.
Para validar el nuevo método, los investigadores han usado proteínas con propiedad de agregación caracterizadas ya experimentalmente. En el modo estático, se pueden estudiar proteínas individuales o complejos proteicos de hasta 20.000 átomos y proteínas de hasta 400 aminoácidos en el modo dinámico.
La agregación proteica se ha convertido en una cuestión clave en biomedicina y biotecnología, ya que el mal plegamiento de las proteínas y la agregación subsecuente están detrás de un número creciente de trastornos neurodegenerativos, como la enfermedad de Alzheimer y la enfermedad de Parkinson.
Fuente: neurologia.com
